En algunos casos se realizan tratamientos previos en los propios tanques de almacenamiento (reducción de Cr hexavalente con ácido ferroso, etc.). En los reactores agitados se mezclan los residuos/reactivos en las proporciones adecuadas. Los residuos de ácidos y bases se pueden neutralizar entre sí, aunque también se puede llegar a emplear lechada de hidróxido cálcico comercial para neutralizar los residuos ácidos o ácido sulfúrico comercial para neutralizar los residuos alcalinos. En el caso de residuos emulsionados como taladrinas, se rompe la emulsión en medio ácido para separar la fase líquida de los aceites. El proceso de neutralización (así como la temperatura) se controla en línea mediante los pH-metros de la instalación.

La instalación cuenta con sistema de lavado de gases conectado a los tanques de almacenamiento y a los reactores para evitar emisiones ácidas a la atmósfera.